2018年6月21日，中国工程院和重庆市人民政府签署协议，合作共建中国工程科技发展战略重庆研究院（以下简称“重庆研究院”），重庆大学、重庆市科学技术研究院为第一、第二共建单位，沙坪坝区政府从场地提供与装修、设施设备配备、运行经费支持、研究项目实施等方面，参与重庆研究院建设。重庆研究院实行理事会领导下的院长负责制，由唐良智市长和李晓红院长任理事长，潘福生院士任院长，成立了周济院士、钟志华院士、张宗益教授、周绪红院士、潘复生院士等26位院士、专家组成的学术委员会。

作为中国工程院和重庆市共建的工程科技区域高端智库，重庆研究院以解决重庆市经济社会及工程科技发展重大需求问题宗旨，围绕人工智能、智能制造、新材料、军民融合等产业领域，传播工程科技和科学发展的理念，为重庆市政府及国家相关部门决策提供智囊支撑，努力建设国内一流的工程科技思想库，为国家工程科技思想库建设作出贡献。

重庆研究院成立以来，已设立重庆市智能制造发展战略研究、重庆市生态文明发展战略研究等重大项目、重点项目39项，组织工程院院士及工程技术专家109名开展项目研究，形成研究报告10份，报送院士专家建议8份，得到重庆市政府领导批示7份，被重庆市相关部门采纳7份，较好地发挥服务重庆科学决策、引领重庆创新发展的智库作用。